邓小平理论和“三个代表”重要思想是新世纪新阶段全党全国各族人民团结奋斗的共同思想基础，也是推进统一战线事业不断发展的强大思想武器。科学发展观是以胡锦涛同志为总书记的党中央，高举邓小平理论和“三个代表”重要思想伟大旗帜，紧密结合全面建设小康社会的生动实践，从党和国家事业发展全局出发提出的重大战略思想，既是指导我们抓住机遇、加快发展的世界观和方法论，也是指导统战工作不断开创新局面的世界观和方法论。在新世纪新阶段，坚持以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，用科学发展观统领统战工作，要注意把握以下几个方面：
要坚持以人为本的观点。以人为本是科学发展观的核心。统战工作作为我们党一项特殊的群众工作和思想政治工作，说到底是做人的工作，特别是做党外代表性人士的工作，政治性很强，人情味很浓，更加需要贯彻以人为本的思想。要按照“尊重人、理解人、帮助人、团结人”的要求，把聚人心、暖人心、稳人心作为统战工作的出发点和落脚点，坚持平等相待、民主协商，正确引导、真诚服务，切实把统一战线广大成员团结到我们党的周围，把他们的智慧和力量凝聚到制定实施“十一五”规划、全面建设小康社会的伟大事业上来。
要坚持全面、联系和发展的观点。统战工作作为党和国家工作的重要组成部分，必须放在党和国家工作全局中去思考、去谋划，在围绕中心中定位，在服务大局中尽职，既要坚持为社会主义经济建设服务，又要为社会主义政治建设、文化建设、社会建设和实现祖国完全统一服务，努力促进经济发展和社会全面进步。统战工作面广线长，涉及众多的领域和方面，彼此相互联系、相互影响。要树立“一盘棋”的思想，学会“弹钢琴”，统筹巩固根本力量与争取新力量、大陆范围内统战工作与大陆范围外统战工作、党外代表人士队伍建设与统战干部队伍建设、上层统战与基层统战、理论研究与工作实践等方面的协调发展，同时要善于抓主要矛盾，以重点问题的解决和难点问题的突破带动各领域工作的全面推进。矛盾都是对立统一的，可以相互转化。统战工作是做团结一切可以团结的力量、化消极因素为积极因素的工作，要能够化弊为利、转危为安，变被动为主动。要随着形势任务的发展变化，把继承与创新、当前与长远结合起来，善于通过思路创新、机制创新、举措创新，使工作不断有所突破、有所创造、有所前进。
要坚持求同存异的观点。统一战线是一定的社会力量为实现一定的共同目标组成的政治联盟，是同和异的矛盾统一体。求同存异是统一战线的一项原则。统一战线工作首先要善于寻求和增进共同点，这是统一战线工作的出发点和目的。统战工作就是要创造条件，突出同、发展同；要创造条件，促进异的变化。当然，对统一战线中各种不同的异要作具体分析。对于对抗性矛盾的异，必须又团结又斗争；对于非对抗性矛盾的异，必须求大同存小异；对于有益于同的异，则要存而不论，以异促同。
