工商联党组受同级统战部领导，这是党中央的明确规定。《意见》进一步强调，“统战部要切实加强对工商联党组的领导，充分发挥工商联党组在工商联中的领导核心作用”。这为做好新世纪新阶段工商联工作提供了重要保证。
一是要坚持党管干部的原则。工商联作为党领导下的具有统战性、经济性和民间性的人民团体和民间商会，不同于一般的社会团体和工商社团，必须坚持党管干部的原则。这是加强党对工商联工作领导的重要体现。统战部要认真履行这方面的职责，把这项工作认真负责地做好。要在对党组成员的任免、对领导干部的管理中，真正把那些政治素质和道德品质好、工作能力比较强、干部群众信得过的优秀人才，充实到工商联党组中来。
二是要建立健全统战部与工商联党组工作联系制度，推动工商联党组贯彻落实党的路线方针和政策，坚持工商联正确的政治方向，加强对会员的团结、教育工作，不断完善工商联党组的工作制度，充分发挥党组作为工商联的领导核心作用。
三是要推动工商联党组搞好与党外代表人士合作共事。这是工商联的统战性所决定的，也是工商联贯彻党的统战政策、体现党的领导的具体表现。工商联党组要搞好与党外代表人士合作共事，必须处理好党组会与主席会，党组书记、副书记与主席、副主席之间的关系，处理好党的组织与个人的关系。要坚持在重大问题包括干部人事问题上，与党外人士充分协商，民主讨论，取得共识。同时，还要加强思想政治工作，搞好政治引导。
